Kaybolan Değişkenler: Gama, Iota ve Mu’dan Dersler

2021’in başlarında Kolombiya’daki bilim adamları endişe verici yeni bir koronavirüs türü keşfettiler. Sonunda Mu olarak bilinen bu varyant, uzmanların bağışıklık sisteminin savunmasından kaçmasına yardımcı olabileceğine inandığı birkaç endişe verici mutasyona sahipti.

Takip eden aylarda Mo, Kolombiya’da hızla yayıldı. Covid-19 vakalarında yeni bir artışı körüklüyor. Ağustos ayının sonunda onlarca ülkede keşfedildi ve Dünya Sağlık Örgütü onu atadı “İlgi değişkeni”.

Nebraska Üniversitesi Tıp Merkezi’nde genetik epidemiyolog ve yazarı olan Joseph Fofer, Değişken üzerine yeni bir çalışma.

Sonra ortadan kayboldu. Bugün, varyant tamamen ortadan kalktı.

Her delta veya omikron için, yerel patlamalara yol açan ama asla küresel hakimiyeti süpürmeyen gama, iota veya mu değişkenleri, değişkenler vardır. Uzmanlar, Omicron’u anlamak kritik bir halk sağlığı önceliği olmaya devam etse de, bu daha az türden öğrenilecek dersler olduğunu söylüyor.

San Diego’daki California Üniversitesi’nden moleküler epidemiyolog Joel Werthem, “Bu virüsün adapte olmayı ve gelişmeyi durdurmaya teşviki yok” dedi. “Geçmişte nasıl yaptığını bilmek, gelecekte neler yapabileceğine hazırlanmamıza yardımcı olacak.”

Gözetim çalışmaları aynı zamanda gözetim boşluklarını ve politika hatalarını da vurgulayarak Amerika’daki uluslararası seyahat yasağının etkili olmadığına ve virüsü neyin işe yaradığına dair daha fazla kanıt sağlayarak, pandeminin erken aşamasında bulaşıcılığın bağışıklıktan daha önemli olduğunu öne sürüyor. kaçınma.

Araştırma ayrıca bağlamın ne kadar önemli olduğunu da vurguluyor; Bazı yerlerde etkisi olan değişkenler, diğerlerinde dayanak bulamıyor. Sonuç olarak, hangi değişkenlerin baskın hale geleceğini tahmin etmek zordur ve gelecekteki değişkenlerin ve patojenlerin üstünde kalmak, neredeyse gerçek zamanlı olarak kapsamlı izleme gerektirecektir.

Dr Werthem, “Viral genom dizisine bakarak ve ‘Biri muhtemelen diğerinden daha kötü’ diyerek çok şey kazanabiliriz” dedi.

Burada Mu görülüyor

Koronavirüs sürekli değişiyor ve yeni varyantların çoğu fark edilmiyor veya adlandırılıyor. Ancak diğerleri, ya hızla daha yaygın hale geldikleri için ya da genomları uğursuz göründüğü için alarm veriyor.

Her ikisi de Mo için doğruydu ve Columbia’ya yayıldı. Sidney Üniversitesi’nde genetik epidemiyolog ve Moe’nun yeni makalesinin yazarı Marie Petron, “İnsanların yakından izlediği birkaç mutasyon içeriyordu” dedi. Beta ve gama dahil olmak üzere diğer immünolojik varyantlarda birkaç sivri protein mutasyonu belgelenmiştir.

Henüz bilimsel bir dergide yayınlanmayan yeni çalışmada bilim insanları Mu’nun biyolojik özelliklerini Alfa, Beta, Delta, Gama ve orijinal virüsünkilerle karşılaştırdı. Mu’nun diğer varyantlardan daha hızlı üremediğini, ancak bağışıklık açısından en zor olanı olduğunu buldular – Omicron dışında bilinen herhangi bir varyanttan antikorlara karşı daha dirençli.

Araştırmacılar, dünyanın dört bir yanından toplanan Mu örneklerinin genomik dizilerini analiz ederek, varyantın yaygınlığını yeniden yapılandırdı. Mu’nun büyük olasılıkla 2020’nin ortasında Güney Amerika’da ortaya çıktığı sonucuna vardılar. Daha sonra keşfedilmeden önce birkaç ay boyunca dolaşıma girdi.

Güney Amerika’nın birçok yerinde genomik gözetimin “eksik ve eksik” olduğunu söyledi. Seattle’daki Fred Hutchinson Kanser Araştırma Merkezi’nde viral evrim uzmanı olan Jesse Bloom. “Bu alanlarda daha iyi izleme olsaydı, Mo’nun ne kadar endişeli olduğunu hızlı bir şekilde değerlendirmek daha kolay olabilirdi.”

Mo ayrıca başka bir meydan okuma sundu. Koronavirüs örneklerinde nadir görülen, çerçeve kayması mutasyonu olarak bilinen bir tür mutasyona sahipti. Bu mutasyonlar, Dr. Fofer de dahil olmak üzere bilim adamları Mu dizilerini bilgisayara yüklemeye çalıştığında hata olarak işaretlendi. GISAIDyeni varyantları izlemek için kullanılan uluslararası bir viral genom deposu.

Bu komplikasyon Mo dizilerinin halkın katılımında gecikmeye neden oldu. Araştırmacılar, bir hastadan bir virüs örneğinin alınması ile GISAID’de kamuya açıklanması arasındaki sürenin Mu vakaları için Delta vakalarından her zaman daha uzun olduğunu buldular.

Dr. Faufer, “Genomun kendisi esasen gözetimde yapay boşluklar yaratıyordu” dedi. “Bu, en azından deneyimlerimize göre, normalde birkaç gün içinde yayınlamaya çalıştığımız haftalar boyunca veriye sahip olmadığımızla sonuçlandı.”

(Araştırmacılar GISAID’in kalite kontrol sistemlerinin önemini vurguladılar ve veri havuzu sorunu çözdü.)

Bu izleme boşluklarını Mu’nun bağışıklık kaçırmalarıyla birleştirin ve alternatif başlamak üzere gibi görünüyordu. Ama öyle olmadı. Bunun yerine, bilim adamları Mo’nun Güney ve Orta Amerika’dan diğer kıtalara yayıldığını, ancak oraya vardığında geniş bir alana yayılmadığını buldular. Dr. Petron, “Bu, bu varyantın Kuzey Amerika ve Avrupa popülasyonlarında beklediğimiz kadar uygun olmadığının bir göstergesiydi” dedi.

Bu büyük olasılıkla Mu’nun kendisini daha da harika bir değişkenle rekabet ederken bulmasıydı: delta. Delta, antikorlardan kaçınma konusunda Mu kadar yetenekli değildi, ancak daha bulaşıcıydı. Dr. Bloom, “Sonunda Delta daha geniş bir alana yayıldı” dedi.

Doğru seçim, doğru zaman

Başarılı varyantları incelemek hikayenin sadece yarısını anlatır. Dr. Petron, “Baskın olmayan değişkenler bir bakıma negatif kontrollerdir” dedi. “Bize neyin işe yaramadığını söylüyorlar ve bunu yaparken değişken uygunluk hakkındaki bilgi boşluklarını doldurmaya yardımcı oluyorlar.”

Delta, Mu’nun yanı sıra Beta, Gamma ve Lambda dahil olmak üzere birçok immünojenik varyanttan daha iyi performans gösterdi. Bu model, tek başına bağışıklık kaçırmanın, varyantın virüsün oldukça bulaşıcı bir versiyonunu aşmasına izin vermek için yeterli olmadığını veya en azından az sayıda insanın bağışıklığa sahip olduğu salgının erken evresinde olmadığını gösteriyor.

Ancak aşılar ve çoklu enfeksiyon dalgaları bağışıklık ortamını değiştirdi. Bilim adamları, son derece zor bağışıklık alternatifinin şimdi daha fazla avantaja sahip olması gerektiğini ve muhtemelen Omicron’un başarısının nedeninin bir parçası olduğunu söyledi.

Yakın tarihli bir başka çalışma, New York City’deki bağışıklıktan kaçan gamanın Daha iyisini yapma eğilimi Önceden var olan bağışıklığın daha yüksek olduğu mahallelerde, bazı durumlarda Covid’in ilk dalgasında sert bir şekilde vuruldukları için. Çalışmanın yazarı Dr. Werthem, “Boşlukta yeni bir değişken göremeyiz, çünkü kendisinden önce gelen tüm değişkenlerin gölgesinde gelir” dedi.

Gerçekten de, geçmişteki değişkenlerin çatışması, başarının büyük ölçüde bağlama bağlı olduğunu ortaya koymaktadır. Örneğin, New York City, Iota varyantının doğum yeri olabilir. İlk kez keşfedildi Kasım 2020’de toplanan virüs örneklerinde. Dr. Petron, “Böylece erken bir dayanak buldu” dedi. Daha taşınabilir Alfa varyantının gelmesinden sonra bile, Iota sonunda sönmeden önce birkaç ay boyunca kasabadaki baskın varyant olarak kaldı.

Ancak Iota ve Alpha’nın Ocak 2021’de çıkış yaptığı Connecticut’ta işler farklı gitti. Operasyonu yöneten Dr. Petroni, “Alfa hemen havalandı, IOTA’nın hiç şansı yoktu” dedi. İki bölgedeki değişkenleri incelemek.

Benzer bir model, çoklu Omicron suşu ile ortaya çıkmaya başladı bile. Amerika Birleşik Devletleri’nde, ilk olarak New York’ta tanımlanan bir varyant olan BA.2.12.1, havalandıGüney Afrika’da iken, BA.4 ve BA.5 yeni bir patlama yaşıyor.

British Columbia Üniversitesi’nde evrimsel bir biyolog olan Sarah Otto, bunun, azalan varyantları incelemek için başka bir neden olduğunu söyledi. Belirli bir zamana ve yere tam olarak uymayan bir alternatif, başka bir yere gidebilir. Aslında, bu kadar erken ortaya çıkması muhtemelen Mo’nun talihsizliğiydi. “Belki de bu varyantı desteklemek için bağışıklığı olan yeterli insan yoktu” dedi.

Ancak bir sonraki endişe verici varyant, asla tutunamayan, bağışıklıktan kaçan bir türün soyundan veya benzeri bir şey olabilir, dedi.

Önceki değişkenlere bakmak, onları içermek için neyin işe yarayıp neyin yaramadığına dair fikir verebilir. Yeni bir gama çalışması bunun daha fazla kanıtını sağlıyor. Uluslararası seyahat yasağıen azından Amerika Birleşik Devletleri tarafından uygulandığı şekliyle, varyantın küresel yayılmasını engellemesi pek olası değildir.

Gama ilk olarak 2020’nin sonlarında Brezilya’da tanındı. O yılın Mayıs ayında, Amerika Birleşik Devletleri, ABD vatandaşı olmayanların çoğunun Brezilya’dan ülkeye seyahat etmesini yasakladı, bu kısıtlama devam ediyor Kasım 2021’e kadar. Ancak gama, Ocak 2021’de Amerika Birleşik Devletleri’nde keşfedildi ve kısa sürede onlarca ülkeye yayıldı.

Gama dünya çapında hiçbir zaman egemen olmadığı için, yaygınlığı üzerine yapılan bir araştırma, seyahat yasağının etkinliğinin “daha temiz” bir resmini sunar. California San Diego Üniversitesi’nde moleküler epidemiyolog ve çalışmanın yazarı olan Titiana Vasilyeva dedi. “Delta gibi değişkenleri incelemek söz konusu olduğunda – her yerde büyük salgınlara neden olan bir şey – bazen kalıp bulmak gerçekten zor, çünkü çok büyük ölçekte ve çok hızlı oluyor” dedi.

Dr Faufer, hızla değişen bir virüsle devam eden küresel sağlık acil durumunda geleceğe odaklanmak için anlaşılabilir bir neden olduğunu söyledi. Dünyanın dikkati Delta’ya ve ardından Omicron’a çevrilirken, o ve meslektaşları eski Mu haberini incelemeye devam edip etmeme konusunda tartıştılar.

Dr. “Ancak, önceden var olan endişe verici değişkenler hakkında sorular soran ve olanları yeniden düşünmeye çalışan yüksek kaliteli çalışmalara hala yer olduğunu düşünüyoruz.”