Kristalografi veritabanı, kağıt fabrikasıyla ilişkili yaklaşık 1000 yapıyı gösterir – Büzülme Monitörü

Kristal yapıların kimyasal bir veri tabanı, kağıt fabrikasının ürünleri olarak tanımlanan makalelerle ilişkili oldukları tespit edildikten sonra endişe ifadeleriyle yaklaşık 1.000 girdi belirledi.

Cambridge Crystal Data Center (CCDC), veri tabanındaki 992 yapıya notlar ekledi. Fark etme Mayıs ayında web sitesinde yayınlandı. Ve bir kristalografi araştırmacısı, alan üzerindeki etkinin önemli olabileceğini söylüyor.

Notları hatırla:

Bu yapı, üretken bir kağıt katmanına ilişkin 2022 tarihli bir çalışmanın ardından şu anda gözden geçiriliyor https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1537438/v1.

A olarak yayınlanan kağıt fabrikasının açıklaması baskı öncesi Nisan ayında, PubPeer yorumcularının Aralık 2021 ile Ocak 2022 arasında atıfta bulunduğu 648 kristalografi makalesini ve dijital tanımlayıcılar sağlamayan dergilerde ek olarak 162 makaleyi belirledi. İlgili makalelerin bir listesi bulunabilir Burada. Dokuz yaprak ve 12 kristal yapı çizildi.

Baskı öncesi özetinde David Bemler şöyle yazıyor:

Burada, 2015-2022 yılları arasında Crystallography ve Exotic Chemistry dergilerinde yayınlanan en az 800 yayının aynı zamanda kurgusal MOF’lar ve bunların tamamen yenilikçi terapötik uygulamalarında uzmanlaşmış üretken bir kağıt fabrikasının eseri olduğunu öneriyoruz. Değirmen, geri dönüştürülmüş fotoğraflar ve yol bölümlerindeki eksantriklik ile ayırt edilir, ancak en ayırt edici özellikleri, uzak bilim alanlarından ilgisiz araştırma alıntılarıyla birlikte referans bölümlerinde görünür.

Ön baskı, editörleri tarafından akran incelemesinden sonra büyük bir inceleme olarak önerildiği bir dergide “inceleniyor” olarak işaretlendi.

Kağıtlardan elde edilen kristal yapılar (bazen bir makalede birden fazla) CCDC’nin Cambridge Yapılandırılmış Veritabanında depolanmıştır. İnternet sitesi “X-ışını ve nötron kırınım analizlerinden elde edilen bir milyondan fazla yapıya” sahip “küçük organik kristal ve organometalik parçacıkların küresel deposu” olarak tanımlanmaktadır.

28 Nisan’da CCDC, “potansiyel olarak sahte verileri” araştırmaya başladığını belirten bir bildiri yayınladı:

Research Square’deki (https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1537438/v1) son baskı öncesi yayınımızın ardından, Cambridge Structured Database’deki (CSD) potansiyel olarak tahrif edilmiş verilerle ilgili araştırmalara başladık.

Yazma sırasında, şu ana kadar CSD’de baskı öncesindeki adlandırılmış gönderilerle ilişkili 620 yapı belirledik. Veritabanı ekibimiz ve veri bütünlüğü bilim adamımız, sorunu tam olarak anlamak için diğer veritabanlarındaki ve ilgili dergilerdeki bağlantılarımızla birlikte çalışmaktadır.

Bu sorunu çok ciddiye alıyoruz. CSD, literatürün doğru bir yansıması olmayı amaçlamaktadır ve bu nedenle, gelişmeleri ilgili dergilerle yakından takip ederek, uygun olduğunda veri çekeceğiz.

Ayrıca, tamamlandıktan sonra WebCSD’de görünecek olan etkilenen tüm yapılara bir not eklemek için çalışıyoruz.

Araştırmamız, hem şirket içinde hem de ortaklarımızla birlikte sorunu ve temel nedenini anlamaya devam ediyor. Daha fazla bilgi edindikçe güncellemeleri burada yayınlayacağız.

Baskı öncesi yazarının yanı sıra bu tür sorunlar ortaya çıktığında bizi uyarmak için çaba sarf eden diğer kişiler tarafından yapılan çalışmaları takdir ediyor ve takdir ediyoruz.

Mayıs güncellemesi, kağıt katmanıyla (992) ilişkili yeni yapı sayısını not eder ve bir uyarı notu örneği içerir.

CCDC’ye birkaç soru içeren bir e-posta gönderdik ve ayrıntılı bir açıklama aldık. Önbaskı yazarına teşekkür ettikten sonra şunları söyledim:

Normal taramalar sırasında bazı yapılardan şüphelenmeye başladık, ancak Geri Çekme İzleme ve topluluktan ön baskılar hakkında bilgi edindikten sonra daha büyük bir araştırma başlattık.

Ön baskıya bir bağlantı ekledik 23 Nisan hafta sonu reytinglerive başladı 25 Nisan’da bununla ilgili tweet atın. CCDC soruşturması, yapılara “ilk adım” olarak eklenen notlarla 28 Nisan’da başladı.

CCDC şu anda CSD’den veri alıyor, ancak beyanına göre girişe uyan bilimsel makale çekilirse. Veritabanındaki yaklaşık 1,2 milyon girişten 400’ü ilgili belgelerle birlikte geri çekildi.

Kağıt fabrikası denetimi ile ilgili olarak:

Başlangıçta işaretlenen 992 binadan 12’si, beraberindeki dokuz levhanın çekildiği CSD’den çekildi. CSD’den veri çekildiğinde, ilgili bibliyografik ayrıntılara sahip giriş mevcut kalır, ancak bilimsel içerik kaldırılır ve giriş, literatürdeki bir geri çekme bildirimine bağlanır. Geri çekmeler hakkında bizi güncel tutmamıza yardımcı olacak tüm büyük yayıncılarla ilişkilerimiz ve iş akışlarımız var ve ayrıca Geri Çekme İzleme gibi kaynakları da izliyoruz…

Baskı öncesi kağıtta yer alan geri kalan 980 yapı için, verileri bilimsel makalelerde yansıtmamıza rağmen, herhangi bir yapının daha fazla araştırma gerektirip gerektirmediğini değerlendiriyoruz. Daha kapsamlı bir analiz için mevcut veri bütünlüğü kontrollerimizi genişlettik ve COPE’nin yönergelerini izleyecek ve bu analizin sonuçlarına göre yayıncılar ve yazarlarla uygun şekilde iletişim kuracağız. Araştırmalarımız, temel veri kümelerinin daha derinlemesine analizini ve veri kümeleri ile CSD’nin karşılaştırmalarını içerir.

Doktora düzeyindeki editörler ve birikim koordinatörlerinden oluşan ekibimiz, özel veri entegrasyonu bilim adamımız da dahil olmak üzere soruşturmaya katılıyor. Bu çabalarda bizi destekleyen kristalografi topluluğundaki diğer uzmanlara da ulaştık. İleriye dönük olarak, daha fazla manuel kontrole ihtiyaç duyan yapıları belirlememize ve önceliklendirmemize yardımcı olacak daha fazla otomatik kontrol ekliyoruz.

Para çekme işlemlerinin zaman çizelgesi zaman alabileceğinden ve daha kapsamlı kontrollerimiz zaman alacağından, araştırma devam ederken kullanıcılarımızın bilgilendirilebilmesi için ek bir editoryal yorum eklemeye karar verdik. Ayrıca, kullanıcılar bunları çalışmalarından hariç tutmak isterse, talep üzerine etkilenen yapılar için tam bir referans kodları listesi sağlayabiliriz.

Kağıt fabrikasıyla ilgili 130 makale yayınlayan Springer Nature’a ve dergide 150 makale yayınlayan Taylor & Francis’e e-posta gönderdik. İnorganik metallerin ve nanopartiküllerin kimyasısonuçlara göre hareket etmeyi planlayıp planlamadıklarını sorar.

Bir Springer Nature sözcüsü, Araştırma Dürüstlüğü Direktörü Chris Graf’tan şu açıklamayı yaptı:

Dürüstlük Ekibimiz, e-postanızı göndermeden önce, makalenin yazarları tarafından endişeleri hakkında bilgilendirilmemiştir. Artık yazarların endişelerini dikkate alacağımızın farkındayız.

Taylor ve Francis’in bir sözcüsü, yayıncının “dergide yayınlanan çok sayıda makaleyi aktif olarak araştırdığını” doğruladı. İnorganik metallerin ve nanopartiküllerin kimyası. “

Dergide yayınlanan iki makalesi halihazırda geri çekilmek biriydi revizyontüm yazarların talebi üzerine, sözcü söyledi ve makaleler devam eden soruşturmanın bir parçası:

Araştırmamız, 2021’de gerçekleştirdiğimiz bir iç denetimle başladı ve araştırmacılar tarafından dile getirilen endişelerin ardından genişletildi. Sorunlu Kağıt Denetleyicisi bu yılın başlarında açıklama. Gerekli özeni göstererek evrakları tamamlamaya ve COPE’nin yönergelerini takip etmeye devam ediyoruz.

Alan adı daha önce dolandırıcılıkla ilgili sorunlar yaşadı. On yıl önce, dergi Acta Crystallographica Bölüm E. 80 sayfayı geri çek Sahte yapılarla. Başka bir durumda, Federal Araştırma Bütünlüğü Ofisi yasaklı Araştırma üretimi için 10 yıllık federal fon alan önde gelen protein kristal tasarımcısı.

Geri Çekme İzleme, Meksika’daki Benemérita Universidad Autónoma de Puebla’da araştırmacı olan Sylvain Bernese’ye sordu: PubPeer’da yayınlandı Endişe ifadeleri hakkında, kristalografi veritabanlarının yapılar hakkında endişe ifadeleri yayınlamak için ne kadar yaygın olduğu hakkında.

Bize söyle:

Bildiğim kadarıyla, EOC’lerin kristalografi veri tabanı ilk kez yayınlandı. Bu hiçbir şekilde yaygın bir uygulama değildir, çünkü genel olarak girdi veri tabanında bulunur veya yoktur. Bulanık noktanın orta noktası anlamsızdır. Bununla birlikte, CCDC’nin ilgili yapıların miktarına şaşırdığını düşünüyorum: Bu özel makaledeki kağıtların %99’u, sistematik olarak CSD’de biriktirilen bir veya birkaç X-ışını yapısına atıfta bulunuyor.

Bernice, CDC yapıları çekmeye son verirse, bu alandaki sonuçların önemli olabileceğini söylüyor:

Bu kağıtlar sonunda geri çekilirse, tüm kristalografik kimya bilimciler topluluğunun etkilenmesi muhtemeldir, çünkü normalde X-ışını yapıları dahil herhangi bir malzeme için kullanılan doğrulamalara olan güven ciddi şekilde bozulacaktır. Öte yandan yanlış verilerle kirlenen bir veri tabanı değerini kaybeder. Örneğin, veri madenciliği, kimyasal kristalografinin önemli bir alt alanıdır ve yapı tahmini, titrasyon ve bilgisayar kimyası yazılımının standart ölçümü vb. ile ilgilidir. Açık nedenlerden dolayı, veri madenciliği büyük ölçüde büyük, kirlenmemiş veri tabanlarına dayanır.

Yine, şimdiye kadar, CCDC yalnızca EOC’leri yayınladı. Umarım etiketli yapıların hiçbiri geri alınmaz. Ancak şu ana kadar incelediğim yapılarda gördüklerime göre tam tersi olma ihtimali yüksek…

İzlemeyi geri almak gibi mi? dosya yapabilirsin Çalışmalarımızı desteklemek için vergiden düşülebilir katkıBizi takip et Twitter’danbizim gibi Facebooktabizi bir profile ekle RSS OkuyucuVeya web sitemize abone olun günlük sindirim. bulursan geri al Veritabanımızda yokYapabildin mi Bize buradan bildirin. Yorumlarınız veya geri bildirimleriniz için bize [email protected] adresinden yazın..

İlişkili